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技术平台

ChomiXDegrade? 是一个基于 TMT/DIA 多沉定量蛋白质组学 的技术平台 ,,,, ,其主题能力是提供深度覆盖(单细胞系定量蛋白超 8,000 种)和精准定量蛋白质丰度变动 。。 。。。它旨在全景式地量化靶向蛋白质降解剂(如 PROTAC、分子胶)对指标蛋白(正靶)的降解效能及其对非指标蛋白(脱靶)的影响 ,,,, ,为降解剂的作用机造验证、选择性优化、脱靶评估以及效力钻研提供关键数据支持 ,,,, ,尤其助力难成药靶点降解剂的开发 。。 。。。

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平台特点

√主题技术支持:结合 TMT 多沉比力与 DIA 高活络度深度覆盖两大技术 。。 。。。其中 ,,,, ,TMT多沉比力可实现单次尝试平行分析多前提 ,,,, ,有效提升尝试效能、削减系统误差; ;;;;;;DIA 高活络度深度覆盖则能活络检测低丰度蛋白 ,,,, ,大幅降低漏靶概率 。。 。。。

√关键量化能力:依附上述技术 ,,,, ,可精准量化降解剂对 “正坝妆 的降解率 ,,,, ,同时清澈评估“脱坝妆 效应 ,,,, ,为降解剂选择性评价提供直接、靠得住的 “硬数据” 。。 。。。

√流程与了局优势:具备尺度化尝试流程 ,,,, ,确保步骤可扩大性; ;;;;;;且能直接检测蛋白质丰度的现实变动(即职能效应直读) ,,,, ,而非依赖间接结合信息 ,,,, ,从而更精准、靠得住地关联降解剂的最终职能成效 。。 。。。


案例展示

项目简介:针对理性设计的PROTAC分子 ,,,, ,在细胞中确定其对靶点的降解成效 ,,,, ,及潜在的脱靶蛋白 。。 。。。

数据展示:别离利用免疫印迹和质谱步骤对指标蛋白的丰度进行定量分析 。。 。。。


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在一次尝试中对肿瘤细胞系中5900个蛋白进行定量分析 ,,,, ,成功确定PROTAC1(图2)和PROTAC2(图3)的降解蛋白以及其他潜在的脱靶蛋白 。。 。。。



有关文件

※通过系统性筛选激酶组降解性 ,,,, ,成立首个激酶靶点可降解性图谱 ,,,, ,揭示 228 种激酶可被 PROTAC 降解 ,,,, ,为加快降解剂开发提供关键资源库与设政战术 。。 。。。 Mapping the Degradable Kinome Provides a Resource for ExpeditedDegrader Development. Cell. 2020, 183(6):1714-1731.(IF: 42.5)



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